A lo largo de su existencia, el Colegio de Postgraduados ha colaborado constantemente con diversas organizaciones e instituciones internacionales en el campo de la actividad agropecuaria y de los recursos naturales. La naturaleza de estas colaboraciones ha sido con un enfoque global o regional.

En este sentido, el Colegio de Postgraduados ha suscrito convenios de cooperación y proyectos de investigación con diversos organismos, universidades e instituciones Internacionales. Tal es el caso de los proyectos cooperativos que se han desarrollado con el Departamento de Agricultura de los Estados Unidos (USDA); con Universidades e Instituciones Educativas del Extranjero.

De este número de instituciones se pueden citar de manera especial: Universidades Estadounidenses (Universidad del Estado de Ohio), universidades europeas (Instituto Politécnico de Madrid) y universidades latinoamericanas (Universidad de San Carlos, Guatemala); asimismo se ha trabajado con la Organización de las Naciones Unidas para la Alimentación y la Agricultura (FAO), el Programa de las Naciones Unidas para el Medio Ambiente(PNUMA), el Instituto Interamericano de Cooperación para la Agricultura (IICA), el Centro Agronómico Tropical de Investigación y Enseñanza (CATIE), entre otros.

Como resultado de propósitos enfocados a reforzar, gestionar y ampliar el ámbito de la cooperación internacional, contribuyendo en el ámbito académico. El CP se ha preocupado por establecer acciones a través de la cooperación científica, técnica y tecnológica por medio de alianzas estratégicas con diversas instancias gubernamentales, organismos multilaterales, foros internacionales, así como  de actores privados en materia agrícola, pecuaria, forestal y otras área afines.

Logrando así su posicionamiento y reconocimiento internacional como Institución de Enseñanza e Investigación en ciencias agrícolas.