La misión del Programa en Innovación Agroalimentaria Sustentable es formar talento humano de alto nivel científico con actitud crítica e innovadora, que contribuya al desarrollo competitivo y sustentable, genere alternativas de solución a problemáticas en producción, transformación y comercialización en sistemas agroalimentarios, con una visión integral que impacte y contribuya a mejorar la calidad de vida de la población.
Ser un Programa de Postgrado en Ciencias con reconocimiento nacional e internacional que fomente el desarrollo humano y profesional de estudiantes y académicos, con la formación de talento humano de alto nivel científico, para que a través de la investigación brinde soluciones innovadoras e integrales a problemáticas de los sistemas agroalimentarios con un enfoque de sustentabilidad y responsabilidad social.